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PyTorch的ONNX结合MNIST手写数字数据集的应用(.pth和.onnx的转换与onnx运行时)

2023-07-13

在PyTorch以前的模型都是.pth格式,后面Meta跟微软一起做了一个.onnx的通用格式。这里对这两种格式文件,分别做一个介绍,依然使用MNIST数据集来做示例

1、CUDA下的pth文件

那pth文件里面是什么结构呢?其实在以前的文章就有介绍过,属于字典类型,而且是有序字典类型,这样就可以按照一定的顺序进行处理。

1.1、了解pth结构

先来查看一下pth文件的内容:
MNIST预训练模型.pth文件

import torch
model=torch.load("lenet_mnist_model.pth",map_location=torch.device('cpu'))
print(type(model),len(model))
for k,v in model.items():
    print(k,v.size())
'''
<class 'collections.OrderedDict'> 8
conv1.weight torch.Size([10, 1, 5, 5])
conv1.bias torch.Size([10])
conv2.weight torch.Size([20, 10, 5, 5])
conv2.bias torch.Size([20])
fc1.weight torch.Size([50, 320])
fc1.bias torch.Size([50])
fc2.weight torch.Size([10, 50])
fc2.bias torch.Size([10])
'''

可以看到类型是OrderedDict,两个卷积层加上两个全连接层。每个层都带有权重和偏置,简单显示了它们的形状。

1.2、torch.device

这里有一个需要注意的地方就是,如果将

model=torch.load("lenet_mnist_model.pth",map_location=torch.device('cpu'))

修改为

model=torch.load("lenet_mnist_model.pth")

就会报如下错误:

RuntimeError: Attempting to deserialize object on a CUDA device but torch.cuda.is_available() is False. If you are running on a CPU-only machine, please use torch.load with map_location=torch.device('cpu') to map your storages to the CPU.

也就是说想在CUDA中做反序列化操作,而CUDA是不可用的,从这里可以看到这个模型的训练是在有CUDA的环境下进行的,所以我们这里指定到CPU设备上。

2、CPU下的pth文件

 我们来看一个在CPU的环境下的加载方法,mnist.pth文件下载地址:mnist.pth

import torch
model=torch.load("mnist.pth")
print(type(model['net']),len(model['net']))
for k,v in model['net'].items():
    print(k,v.size())

'''
<class 'collections.OrderedDict'> 10
conv1.weight torch.Size([6, 1, 3, 3])
conv1.bias torch.Size([6])
conv2.weight torch.Size([16, 6, 3, 3])
conv2.bias torch.Size([16])
fc1.weight torch.Size([120, 400])
fc1.bias torch.Size([120])
fc2.weight torch.Size([84, 120])
fc2.bias torch.Size([84])
fc3.weight torch.Size([10, 84])
fc3.bias torch.Size([10])
'''

这里可以不指定map_location参数,默认是cpu设备,可以看到这个pth文件结构是两个卷积层加三个全连接层。

3、pth转onnx

我们根据上面的mnist.pth结构,自己来构造一个模型:

import torch
import torch.nn as nn
import torch.nn.functional as F

class LeNet(nn.Module):
    def __init__(self):
        super(LeNet, self).__init__()
        self.conv1 = nn.Conv2d(in_channels=1,out_channels=6,kernel_size=3,stride=1,padding=0)
        self.conv2 = nn.Conv2d(in_channels=6,out_channels=16,kernel_size=3,stride=1,padding=0)
        self.fc1   = nn.Linear(400, 120)
        self.fc2   = nn.Linear(120, 84)
        self.fc3   = nn.Linear(84, 10)
 
    def forward(self, x):
        out = self.conv1(x) # torch.Size([1, 6, 26, 26])
        out = F.max_pool2d(F.relu(out), 2) # [1, 6, 13, 13]
        out = self.conv2(out) # [1, 16, 11, 11]
        out = F.max_pool2d(F.relu(out), 2)  # [1, 16, 5, 5]
        out = out.view(out.size(0), -1) # [1, 400]
        out = self.fc1(out) # [1, 120]
        out = self.fc2(F.relu(out)) # [1, 84]
        out = self.fc3(F.relu(out))  # [1, 10]
        return out

net = LeNet()
net = net.to('cpu')
checkpoint = torch.load('mnist.pth')
net.load_state_dict(checkpoint['net'])
batch_size = 1
input_shape = (1,28,28)
x = torch.randn(batch_size,*input_shape)
net.eval()
torch.onnx.export(net,x,"mnist.onnx")

构造一样的结构,加载mnist.pth,然后就可以通过export转换成onnx格式的文件了。我们上传到https://netron.app/ 站点,可视化整个模型图,然后点击每个节点,将在右边出现它们的属性值:

4、onnx运行时

onnxruntime主要是拿来推理,当然在ir7的版本也增加了训练等功能,我们来了解下这个东西 

4.1、安装模块

如果缺少onnxruntime模块,就会报错:

ModuleNotFoundError: No module named 'onnxruntime'

这里在JupyterLab中,所以在前面加一个叹号安装

!pip install onnxruntime -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host pypi.douban.com

import torch
import onnxruntime as ort
import numpy as np

session = ort.InferenceSession("mnist.onnx")
x = np.random.rand(1, 1, 28, 28).astype(np.float32)
outputs = session.run(None, {"input": x})
print(outputs[0])

4.2、名称一致 

这里容易出错:InvalidArgument: [ONNXRuntimeError] : 2 : INVALID_ARGUMENT : Invalid Feed Input Name:input

也就是说这个sess.run([output_name], {input_name: x})中的输入名称错误,所以名称要一样,这里的输入名称是input.1,修改成outputs = session.run(None, {"input.1": x})就可以了
怎么查看名称,可以通过上面站点可视化直接看到名称,也可以使用下面代码获取

input_name = session.get_inputs()
print(input_name[0].name)#input.1

同样的,如果输出名称也想指定,可以使用下面代码获取

out_name = session.get_outputs()[0].name

4.3、三通道转一通道

彩色三通道的图片转成灰色的单通道图片:

import cv2
import numpy as np
img = cv2.imread('1.png', cv2.IMREAD_GRAYSCALE)
cv2.imwrite('1.jpg',img)
print(img.shape)#(28, 28)

5、转成json格式

有时候的需求需要可读文件,一般json是很常见的,也可以进行转换:

import onnx
import json
from google.protobuf.json_format import MessageToJson
 
onnx_model = onnx.load("mnist.onnx")
s = MessageToJson(onnx_model)
onnx_json = json.loads(s)
 
output_json_path = 'mnist2.json'
 
with open(output_json_path, 'w') as f:
    json.dump(onnx_json, f, indent=2)

这样就将onnx文件转成了json格式的文件了

引用来源
github:https://github.com/onnx/onnx
可视化模型:https://netron.app/
ONNX实践:http://www.icfgblog.com/index.php/software/227.html

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